для покадровой нужна по сути только одна вещь - железная задница. это сел и рисуй 8 часов подряд ради 2х секунд анимации ))
флеш для анимации кстати очень даже не плох. есть студии, которые в нём продукты гонят. более крутые варианты - тюн-бум, аниме студия, афтер эффект вместе с фотошопом, иллюстратором, скетчапом, тд тп. в большинстве случаев что-то одно не используют, а кучу, как минимум по направлениям, типа фон, персонажка, эффекты, монтаж, тд тп. вопрос в задаче, качестве, количестве и возможностях. в основе же везде всё одно и тоже - сценарий, раскадровка, аниматик, фазовка, прорисовка
есть книга которая в глубь рассматривает классическую анимацию -
http://www.amazon.com/The-Animators-Survival-Richard-Williams/dp/0571202284. название говорит само за себя )